排序-如何在Bash中按排序顺序循环播放所有文件？

for i in `ls *.fas | sort -V`; do some_code; done;

其中ls根据man sort做版本排序-文本中自然的（版本）数字排序

同样只使用ls：

for i in `ls -v *.fas`; do echo $i; done;

您将以ASCII顺序获取文件。 这意味着r早于-k2,2n。我意识到您无法重命名文件（我的生物信息学家的大脑告诉我它们包含染色体数据，而我们根本不将1号染色体称为“ chr01”），因此这是另一种解决方案（不使用-k2,2nr 我在使用的任何操作系统上都找不到）：

ls *.fas | sed 's/^\([^0-9]*\)\([0-9]*\)/\1 \2/' | sort -k2,2n | tr -d ' ' |
while read filename; do
  # do work with $filename
done

这有点令人费解，不适用于包含空格的文件名。

另一个解决方案：假设我们想按大小顺序遍历文件，这可能更适合某些生物信息学任务：

du *.fas | sort -k2,2n |
while read filesize filename; do
  # do work with $filename
done

要反转排序，只需在-k2,2n之后添加r（以获得-k2,2nr）。

使用选项sort -g时，它将根据常规数值进行比较

 for FILE in `ls ./raw/ | sort -g`; do echo "$FILE"; done

0.log1.日志2.日志...10.日志11.日志

仅当文件名是数字时，这才起作用。 如果它们是字符串，则将按字母顺序获取它们。 例如。：

 for FILE in `ls ./raw/* | sort -g`; do echo "$FILE"; done

raw / 0.lograw / 10.lograw / 11.log...raw / 2.log

您是说列表中编号为10的文件位于编号3之前？ 那是因为0非常简单地对其结果进行排序，因此something-10.whatever小于something-3.whatever。

一种解决方案是重命名所有文件，使它们具有相同的数字位数（其中具有一位数字的文件以0开头）。

while IFS= read -r  file ; do
    ls -l "$file" # or whatever
done < <(find . -name '*.fas' 2>/dev/null | sed -r -e 's/([0-9]+)/ \1/' | sort -k 2 -n | sed -e 's/ //;'

解决该问题，假定文件命名保持一致，不依赖于最新版本的GNU sort，不依赖于读取ls的输出，并且不会成为管道到同时问题的受害者。

就像@Kusalananda的解决方案（也许更容易记住吗？），但可以满足所有文件的需要（？）：

array=("$(ls |sed 's/[^0-9]*\([0-9]*\)\..*/\1 &/'| sort -n | sed 's/^[^ ]* //')")
for x in "${array[@]}";do echo "$x";done

从本质上说，添加排序键，排序，删除排序键。

编辑：将评论移至适当的解决方案

使用sort -rh和while循环

du -sh * | sort -rh | grep -P "avi$" |awk '{print $2}' | while read f; do fp=`pwd`/$f; echo $fp; done;